动物科技学院是我校建院最早的专业学院之一，也是具备硕士研究生培养资格最早的学院，办学历史可追溯到1907年成立“农学堂”时创办的牧医专业。2023年学院被评为吉林省专业特色学院。

学院现有动物医学、动物科学、动植物检疫、野生动物与自然保护区管理和动物医学-中韩合作办学5个本科专业以及畜牧兽医、宠物养护与驯导2个专科专业。动物医学专业为国家级一流本科专业、国家级卓越农林人才改革试点专业；野生动物与自然保护区管理专业为国家级特色专业、省级一流专业；动物科学专业为省级一流专业；动植物检疫专业为校级特色专业。